张和平、魏泓和徐健等揭示，乳腺炎可由肠道菌群引起
今天是第927期日报。
乳腺炎
张和平+魏泓+徐健：肠道菌群可能引发乳腺炎
Microbiome[IF:9.133]
① 给无菌小鼠移植乳腺炎奶牛的粪便菌群，可引起小鼠乳腺炎症状，以及血清、脾脏和结肠中的炎症，而移植健康奶牛的粪菌无此作用；② 补充干酪乳杆菌，可减轻移植患病奶牛粪菌的小鼠的乳腺炎症状；③ 益生菌未显著改变受体中失调的肠道菌群，但改变了菌群功能，与健康和乳腺炎菌群的均有区别；④ 虽然奶牛与小鼠的乳腺炎症状一致，但二者肠道菌群中乳腺炎相关细菌或功能标志物的共性较少；⑤ 健康与患病奶牛的肠道菌群差异，在受体小鼠中被放大。
Cow-to-mouse fecal transplantations suggest intestinal microbiome as one cause of mastitis
11-08 DOI: 10.1186/s40168-018-0578-1
【主编评语】内蒙古农业大学张和平、华中农业大学魏泓和中科院青岛生物能源与过程研究所徐健等合作主导的研究，近期在Microbiome发表。该研究通过奶牛到小鼠的跨物种粪菌移植，证实失调的肠道菌群可能是引发乳腺炎的原因之一，恢复肠道菌群功能的益生菌是潜在的治疗策略。（@mildbreeze）
粪菌移植
Nature子刊：免疫检查点抑制剂相关结肠炎可用粪菌移植治疗
Nature Medicine[IF:32.621]
① 使用免疫检查点抑制剂（ICI）进行癌症治疗后发生难治性ICI相关结肠炎的两位患者，接受来自同一健康供体的粪菌移植（FMT），分别在1次和2次FMT后达到症状的完全缓解；② FMT后，患者结肠粘膜处的T细胞组成发生改变（CD8+细胞毒性T细胞明显减少，而CD4+FoxP3+T细胞增多/保留），可能是FMT疗效的潜在机制；③ 患者的肠道菌群在FMT后很快变得与供体类似，之后与供体的相似度减少，但仍不同于FMT之前的菌群；④ 需扩大样本验证该方法的有效性。
Fecal microbiota transplantation for refractory immune checkpoint inhibitor-associated colitis
11-12 DOI: 10.1038/s41591-018-0238-9
【主编评语】用于癌症治疗的免疫检查点抑制剂（ICI）可引起结肠炎等不良反应，重者可致命，有研究指出其发病与肠道菌群的改变有关。Nature Medicine发表了由德克萨斯大学MD安德森癌症中心的华人学者Yinghong Wang主导的最新研究，报道了用粪菌移植（FMT）成功治疗难治性ICI相关结肠炎的案例，提示调节肠道菌群的干预方法可用于改善ICI相关结肠炎，有望造福患者。（@mildbreeze）
心血管
NEJM：EPA乙酯可降低高甘油三酯血症患者的心血管风险
New England Journal of Medicine[IF:79.258]
① 一项多中心、随机、双盲、安慰剂对照试验，纳入8179名用他丁类药物治疗但甘油三酯水平仍较高的高心血管风险患者，其中治疗组每天服用4克二十碳五烯酸乙酯，中位随访时间4.9年；② 与安慰剂组相比，治疗组中，心血管事件主要复合终点、关键次要复合终点、缺血事件的风险，分别显著降低25%、26%和20%；③ 治疗组中发生心房纤颤或扑动而入院的患者比例、严重出血事件发生率，高于安慰剂组。
Cardiovascular Risk Reduction with Icosapent Ethyl for Hypertriglyceridemia
11-10 DOI: 10.1056/NEJMoa1812792
【主编评语】二十碳五烯酸（EPA）是鱼油中的一个主要脂肪酸成分，有临床研究表明高剂量EPA及纯化的EPA乙酯，可降低高甘油三酯血症患者的心血管事件风险。REDUCE-IT是一项3b期临床试验，纳入全球约470个中心、共8000多名受试者，中位随访近5年。该研究发现，在用他丁类药物但甘油三酯水平仍然较高的高心血管风险人群中，补充高剂量EPA乙酯可显著降低心血管死亡、心肌梗死、脑卒中、冠状动脉血运重建和不稳定心绞痛等心血管事件风险。虽然鱼油用于预防心血管疾病的效果可能并不显著，但其所含的特定纯化成分及其衍生物，有望作为膳食补剂降低特定人群的心血管风险。（@mildbreeze）
自闭症
自闭症儿童肠道菌群相关表位的变化
Brain Behavior and Immunity[IF:6.306]
① 对自闭症（ASD）（有胃肠道疾病19名，无此病24名）和正常发育（TD）儿童（31名）的肠道菌群相关表位（ME）进行分析；② 利用ME可区分三组儿童，有胃肠道疾病的ME更多样化；③ ASD与TD间有34种ME存在差异，其中：29种丰度降低且与IgA和肠道菌群组成异常相关，11种为病原微生物多肽，9种与自身免疫性疾病相关；④ 5种ME丰度增加，包括3种癌症相关（GJA1、Pax-3和EYA1），及1种致病性单核细胞增多性李斯特氏菌的李斯特菌属溶血素O肽同源蛋白。
Alteration of gut microbiota-associated epitopes in children with autism spectrum disorders
10-27 DOI: 10.1016/j.bbi.2018.10.006
【主编评语】Brain Behavior and Immunity上发表的一项最新研究，鉴定出了相比于正常儿童，自闭症患儿的肠道菌群相关表位变化，这些表位中包含了与自身免疫、癌症相关的表位以及部分病原微生物多肽。（@沈志勋）
情感障碍
情感障碍风险与肠道菌群相关
Acta Psychiatrica Scandinavica[IF:4.984]
① 纳入128对单合子双胞胎，分析情感障碍与肠道菌群的关系；② 与情感障碍低风险双胞胎相比，缓解期双胞胎肠道菌群出现异常，多样性较低，且缺少属于Christensenellaceae科的特定OTU，具有情感障碍高遗传风险的双胞胎具有同样趋势；③ 该结论不受生活方式，如吸烟、饮酒、体质指数或精神药物等影响；④ 异常菌群及特定OTU可作为易损标记，来研究个体基因与环境互作对遗传上易患情感障碍个体的影响。
Remitted affective disorders and high familial risk of affective disorders associate with aberrant intestinal microbiota
10-29 DOI: 10.1111/acps.12976
【主编评语】来自Acta Psychiatrica Scandinavica上发表的一项最新研究，对128对单合子双胞胎进行分析，发现肠道菌群的多样性、组成及特定OTU与情感障碍风险相关。（@沈志勋）
肿瘤免疫治疗
复旦大学：薯蓣皂苷元可调节肠道菌群，提升PD-1抗体的抗肿瘤效应
Cell Death and Disease[IF:5.638]
① 在黑色素瘤小鼠中，薯蓣皂苷元可发挥抗黑色素瘤功效，并可改善肠道菌群的组成；② 该功效更多地依赖于抗肿瘤免疫，而不是直接的肿瘤抑制活性；③ 抗生素通过扰乱肠道菌群，可减弱薯蓣皂苷元的治疗效果和其引起的免疫反应；④ PD-1抗体与薯蓣皂苷元联合用药，可通过增强T细胞反应促进肿瘤坏死和凋亡；⑤ 薯蓣皂苷元可作为微生态调节剂，诱导抗肿瘤免疫，提高免疫检查点抗体的功效，使其更适合恶性肿瘤的治疗。
Diosgenin promotes antitumor immunity and PD-1 antibody efficacy against melanoma by regulating intestinal microbiota
10-10 DOI: 10.1038/s41419-018-1099-3
【主编评语】来自复旦大学Li Ye团队在Cell Death and Disease上发表的一项最新研究，发现薯蓣皂苷元可通过调节小鼠的肠道菌群，提升PD-1抗体对黑色素瘤的杀伤作用。（@沈志勋）
土壤菌群
华中农大：水稻土中的汞甲基化细菌
Environmental Science & Technology[IF:6.653]
① 某些厌氧微生物的hgcAB基因簇可将汞转化为甲基汞；② 通过测序分析，发现水稻土中可将汞甲基化的菌群群落大多是铁还原细菌（地杆菌属等）及产甲烷菌，少部分为hgcA+ 硫酸盐还原细菌；③ 土壤中的甲基汞含量与携带hgcA基因的地杆菌属细菌的相对丰度呈正相关；④ 系统发育分析鉴定出一些hgcAB基因序列，与三种新发现的汞甲基化细菌相关，分别属于地杆菌属、除硫单胞菌属、脱硫弧菌属。
Unraveling microbial communities associated with methylmercury production in paddy soils
10-17 DOI: 10.1021/acs.est.8b03052
【主编评语】大米是人类暴露于神经毒素甲基汞的一种重要途径。来自华中农业大学团队在Environmental Science & Technology上发表的一项最新研究，对水稻土中的汞甲基化细菌群落进行了鉴定。（@沈志勋）
rRNA测序
新引物扩展 18S rRNA 测序检测范围
Microbiome[IF:9.133]
① 单细胞真核生物和寄生虫是重要的人类病原体，但缺少方便特异的检测手段；② 本文设计多对 18S rRNA 基因引物，可以检测多数单细胞真核生物和寄生虫，包括顶复动物、变形虫、酵母、双滴虫、动质虫、线虫、扁形动物和微孢子虫等；③ 使用NCBI数据库模拟评估扩增产物的长度范围、分辨率等指标适合Illumina测序，自然样品评估结果也覆盖绝大多数目标类群；④ 本方法是对目前rRNA扩增子测序的有效补充，有助于更全面的认识微生物组。
A high-throughput sequencing assay to comprehensively detect and characterize unicellular eukaryotes and helminths from biological and environmental samples
10-29 DOI: 10.1186/s40168-018-0581-6
【主编评语】作者针对单细胞真核生物和寄生虫等设计了新的 18S rRNA 扩增引物，大大提高了对这些物种的检测灵敏度，有助于更全面的认识微生物组。（@gaoch）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，MAY DAY，女巫，沈志勋，Adam刘永鑫-中科院-宏基因组
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