益生菌机制研究再登Nature！| 热心肠日报
今天是第894期日报。
Nature：芽孢杆菌益生菌清除致病菌的机制
Nature[IF:41.577]
① 分析泰国农村的200个健康个体，发现肠内存在芽孢杆菌（主要是枯草芽孢杆菌）的人，肠道和鼻腔中没有金黄色葡萄球菌定殖；② 小鼠实验表明，金黄色葡萄球菌需要Agr群体感应系统来实现肠道定殖，芽孢杆菌产生的脂肽芬荠素，与Agr群体感应中的关键因子AIP有相似结构，可干扰Agr信号转导，从而抑制Agr群体感应；③ 给小鼠灌胃枯草芽孢杆菌孢子，可完全消除金黄色葡萄球菌的肠道定殖，而不产生芬荠素的枯草芽孢杆菌无此作用。
Pathogen elimination by probiotic Bacillus via signalling interference
10-10 DOI: 10.1038/s41586-018-0616-y
肠道菌群可影响心肌梗死结局
Circulation[IF:18.88]
① 口服抗生素（ABX）减少肠道菌群后，小鼠心肌梗死（MI）死亡率随ABX用量增多而显著上升；② 缺乏肠道菌群，使小鼠短链脂肪酸（SCFA）水平和髓系细胞比例降低，MI后围梗死区CX3CR1+单核细胞浸润减少，致MI后心脏修复受损；③ 粪菌移植、单核细胞移植、补充SCFA，均显著改善ABX小鼠MI后的生理和生存情况；④ MI引起肠道菌群改变，乳杆菌属减少，给ABX小鼠在MI前补充混合乳杆菌，可促进丙酸生成、恢复髓系细胞比例，有心血管保护作用。
Loss of Gut Microbiota Alters Immune System Composition and Cripples Post-Infarction Cardiac Repair
10-08 DOI: 10.1161/CIRCULATIONAHA.118.035235
Cell子刊：肠道干细胞通过代谢调控来适应营养条件
Developmental Cell[IF:9.616]
① 在果蝇中肠模型中，肠道干细胞（ISC）利用氨基己糖生物合成途径（HBP）来监测并适应营养条件；② HBP调节ISC的丙酮酸代谢，HBP活性的升高促进ISC发生类似瓦氏效应的代谢重编程，使得ISC可根据营养含量调整分裂速率；③ HBP与胰岛素信号通路互作，影响ISC增殖，HBP活性是促进胰岛素信号诱导的ISC增殖的重要因子；④ ISC固有的氨基己糖合成过程可调节代谢通路的活性，并决定了ISC对来自生境的特定生长信号的反应。
Stem Cell Intrinsic Hexosamine Metabolism Regulates Intestinal Adaptation to Nutrient Content
09-07 DOI: 10.1016/j.devcel.2018.08.011
琥珀酸受体或是治疗IBD的新靶点
Mucosal Immunology[IF:7.36]
① 琥珀酸聚集在炎症区域，通过琥珀酸受体SUCNR1调节免疫；② 克罗恩病（CD）患者的血清和肠道琥珀酸水平上升，肠组织和成纤维细胞中琥珀酸受体SUCNR1表达增加，SUCNR1与肠纤维化标志物α-SMA的表达正相关、与CD86、CD206和α-SMA+细胞共存；③ SUCNR1介导巨噬中促炎因子的表达、巨噬细胞极化和成纤维细胞活化，敲除SUNCR1可使小鼠抵抗实验诱导的抗结肠炎和肠纤维化；④ CD患者肠道中，SUCNR1信号可加剧炎症和纤维化，有望成为新的CD药物靶点。
Succinate receptor mediates intestinal inflammation and fibrosis
10-02 DOI: 10.1038/s41385-018-0087-3
补充脱落酸或能改善高脂饮食引起的脑内炎症和胰岛素抵抗
Molecular Neurobiology[IF:5.076]
① 高脂饮食（HFD）大鼠的大脑海马体中，胰岛素受体底物IRS1增高、IRS2下降，TNFα和淀粉样前体蛋白APP表达增加，神经营养因子BDNF表达降低，神经生成减少；② TNFα与IRS1正相关、与IRS2负相关，APP仅与IRS1正相关；③ 补充脱落酸（ABA）可预防HFD诱导的记忆障碍和神经炎症，恢复海马体中上述因子的表达水平和神经生成；④ 结论：HFD对海马体中IRS1和IRS2的表达调控有不同影响，补充ABA可减少神经炎症和胰岛素抵抗、促进神经生成。
Abscisic Acid Supplementation Rescues High Fat Diet-Induced Alterations in Hippocampal Inflammation and IRSs Expression
05-02 DOI: 10.1007/s12035-018-1091-z
哪些因素影响了蚊子的肠道菌群
Microbiome[IF:9.133]
① 利用16S rRNA 测序方法，研究年龄、饮食、种类、地理位置等因素对哥伦比亚地区两种主要疟疾病原携带蚊（那尼按蚊和达林按蚊）的肠道菌群组成的影响；② 蚊子的大多数肠道菌群是在幼虫期获得的，蚊子的发育时期对肠道菌群的影响最大， 其次是地理位置，而蚊子的种类和饮食影响力最小；③ 蚊子的肠道菌群可以帮助其抵抗环境细菌的入侵；④ 对蚊子肠道菌群组成的调节因素的深入研究，为病媒生物防除策略提供了参考依据。
Factors shaping the gut bacterial community assembly in two main Colombian malaria vectors
08-27 DOI: 10.1186/s40168-018-0528-y
Nature子刊：根际菌群变化可使易感番茄品种更抗病
Nature Biotechnology[IF:35.724]
① 两个品种的番茄，一种能够抗青枯雷尔氏菌引起的青枯病，另一种对其敏感；② 两种番茄的根际菌群中，黄杆菌在抗性品种中占优，而芽孢杆菌和β变形菌则在易感品种中占优；③ 将抗性品种移植到易感品种生长过的土壤中，抗性品种也能感病，反之则易感品种能抗病；④ 两个品种的根系分泌物对致病菌的生长都没有抑制作用，因而认为是根际菌群影响了植株抗病性；⑤ 分离到与病原菌有拮抗作用的黄杆菌，将其接种到土壤中可防止易感品种发病。
Rhizosphere microbiome structure alters to enable wilt resistance in tomato
10-08 DOI: 10.1038/nbt.4232
Nature子刊：从土壤中取利福平同源物，杀耐利福平细菌
Nature Communications[IF:12.353]
① 利用简并引物从约1500个土壤样本DNA中扩增利福平生物合成基因簇（BGC），发现大约一半的土壤中含有类利福平的BGC；② 通过黏粒文库筛选最终得到3个利福平类似物，确定其分子结构后命名为康乐霉素（kanglemycin）；③ 康乐霉素也能与RNA聚合酶结合，具有与利福平相同的核心作用位点；④ 不过，一些康乐霉素特有的基团还能与RNA聚合酶建立新的联系，产生了新的作用位点；⑤ 新的作用位点通过干扰5'起始底物结合的方式对利福平耐药菌发挥作用。
Rifamycin congeners kanglemycins are active against rifampicin-resistant bacteria via a distinct mechanism
10-08 DOI: 10.1038/s41467-018-06587-2
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，女巫，Cherry，梦垚，兵兵，gaoch
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