膳食补充剂未必有益健康，好好吃饭是正道 | 热心肠日报
今天是第1068期日报。
3万人数据揭示膳食补充剂和营养素来源与死亡率的关联
Annals of Internal Medicine[IF:19.384]
① 一项前瞻性队列研究，纳入30899名20岁以上成年美国人，中位随访6.1年，分析使用膳食补充剂以及来自饮食和膳食补充剂的营养摄入与死亡率的关联；② 足量摄取维生素A、维生素K、镁、锌和铜可以降低全因和心血管疾病死亡率，但是只有食物源的上述营养物质才有这种促健康作用；③ 用营养补充剂补充上述营养物质，对降低死亡率没有促进作用；④ 过量钙与癌症死亡率上升相关，该死亡风险与每天摄取>1000mg膳食补充剂来源的钙相关。
Association Among Dietary Supplement Use, Nutrient Intake, and Mortality Among U.S. Adults: A Cohort Study
04-09, doi: 10.7326/M18-2478
【主编评语】《Annals of Internal Medicine》发表的一项最新人群研究，对3万多名成年美国人进行长期跟踪，发现充足的饮食来源的维生素A、维生素K、镁、锌和铜与死亡风险降低相关，通过膳食补充剂补充上述物质对降低死亡率没有助益，而过量补充膳食补充剂来源的钙还可能增加癌症死亡风险。该结果指出，膳食补充剂对美国成年人没有助益。（@小肠君）
Nature子刊：寄生虫产物调节菌群-骨髓轴
Nature Communications[IF:12.353]
① 胃肠蠕虫可通过调节菌群和抑制与失调相关的慢性炎症，预防肠道和肺粘膜炎症；② ES-62是一种由组织驻留型魏氏棘唇线虫分泌的免疫调节剂，可调节肠道菌群、缓和疾病状态；③ ES-62的肠道菌群调节、疾病缓和作用不依赖于蠕虫感染，保护作用也不仅限于黏膜疾病；④ 在类风湿关节炎的小鼠模型中，皮下注射ES-62可预防胶原诱导的关节炎，该过程与肠道菌群正常化、肠道屏障完整性得到维持有相关性。
The parasitic worm product ES-62 normalises the gut microbiota bone marrow axis in inflammatory arthritis
04-05, doi: 10.1038/s41467-019-09361-0
【主编评语】胃肠道寄生虫参与肠道菌群调控和慢性炎症抑制。《Nature Communications》近期发表研究，发现肠道线虫分泌的免疫调节剂ES-62，可以在不依赖于线虫感染的情况下调节肠道菌群、预防胶原诱导的关节炎。该结果不仅有助于菌群-免疫互作研究，对探索肠道寄生虫-肠道菌群-宿主互作同样具有参考价值。（@小肠君）
Nature子刊：Rnf5敲除小鼠的肠道菌群促进其抗肿瘤免疫
Nature Communications[IF:12.353]
① 敲除泛素连接酶RNF5的小鼠，其抗肿瘤免疫应答增强，可抑制黑色素瘤生长，与肠道菌群有关；② 抗生素处理或与野生型小鼠共饲，均可削弱Rnf5-/-小鼠的抗肿瘤免疫，而移植其富集的12株菌或其中的鼠拟杆菌，可增强受体小鼠的抗肿瘤免疫；③ Rnf5-/-小鼠肠道中，抗菌肽表达减少、炎性体组分表达增加、树突细胞募集并活化；④ Rnf5-/-小鼠的未折叠蛋白反应（UPR）组分活化减弱，可能诱导了菌群和免疫变化；⑤ 响应免疫疗法的患者中也存在UPR减少。
Gut microbiota dependent anti-tumor immunity restricts melanoma growth in Rnf5−/− mice
04-02, doi: 10.1038/s41467-019-09525-y
【主编评语】《Nature Communications》近期发表一项研究，发现敲除泛素连接酶RNF5的小鼠具有较强的抗肿瘤免疫，在一定程度上是由其特殊的肠道菌群所介导，并表明其菌群与免疫的变化可能是由未折叠蛋白反应的改变诱导的。这些发现对于靶向菌群以强化癌症免疫疗法，以及研究菌群-免疫互作，都有参考价值。（@李丹宜）
Nature子刊：用单拷贝基因系统发育方法分析OTU
Nature Communications[IF:12.353]
① 本研究基于单拷贝系统发育标记基因的微生物分类方法，更新扩展了原有的mOTU数据库，开发了新分析工具mOTUs2；② 新版数据库从已知参考基因组和宏基因组数据中提取更新合并了>7,700个mOTU，显著改善人类相关和海洋微生物物种的代表性；③ mOTUs2适用于宏基因组数据的微生物分类分析，宏转录组数据的微生物转录活性分析，及微生物群体的SNV分析；④ 与其他方法相比，mOTUs2对已知和未知物种的灵敏度和定量准确度都有所提高。
Microbial abundance, activity and population genomic profiling with mOTUs2
03-04, doi: 10.1038/s41467-019-08844-4
【主编评语】16S rRNA基因用于系统分类学研究的地位已经不稳了。之前就有研究人员通过单拷贝基因构建了新的生命之树（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1087194889），发现有明显优势。《Nature Communications》近期发表研究，又进一步基于新的生命之树开发了mOTUs2菌群分析工具。随着宏基因组测序的不断发展，这种分析方法或许将成为菌群结构分析的标准动作之一，非常值得关注！（@高春辉）
揭秘S24-7科细菌
Microbiome[IF:9.133]
① 拟杆菌门S24-7菌科在肠道菌群中广泛存在，小鼠是最常见的宿主（平均相对丰度和共现菌种数为20%和9）；② 用全长16S rRNA基因序列聚类推断出该科685个菌种，另用宏基因组学方法从小鼠肠道样本中重构了该科59个菌种的基因组草图，两者间有34个物种重叠；③ 分离培养出3个菌种的5个菌株，鉴定出2个新菌属；④ 基因组分析表明该科在功能和种系发生方面不同于相邻菌科，且在降解复杂碳水化合物上具有功能多样性；⑤ 建议命名该科为Muribaculaceae。
Sequence and cultivation study of Muribaculaceae reveals novel species, host preference, and functional potential of this yet undescribed family
02-19, doi: 10.1186/s40168-019-0637-2
【主编评语】S24-7这个名字对于研究肠道菌群研究的人而言可能并不陌生，它是小鼠肠道内拟杆菌目的一个优势菌科，但是其分类和序列数据注释仍存在模糊之处。《Microbiome》近期发表一项研究，从16S rRNA、细菌基因组、宏基因组学、分离培养等技术层面，对S24-7科细菌的多样性、生态学、功能潜力、种系发生等问题和特征进行分析和描述，并建议将其命名为Muribaculaceae。（@李丹宜）
银屑病患者的肠道菌群紊乱现象
British Journal of Dermatology[IF:6.129]
① 对同一地区的19例银屑病患者和20例健康人的粪便菌群进行16S扩增子测序和分析；② 与健康人相比，银屑病患者的肠道菌群出现紊乱，肠道菌群多样性较低；③ 四大优势菌门中，患者菌群中放线菌门和厚壁菌门相对丰度增高，而拟杆菌门和变形杆菌相对丰度降低；④ 银屑病患者的双歧杆菌科、毛螺菌科等相对丰度增加，拟杆菌科、普雷沃氏菌科、理研菌科等相对丰度降低；⑤ 银屑病患者肠道菌群紊乱现象为研究基于微生物学的治疗方法的应用奠定了基础。
Gut microbiota dysbiosis in a cohort of psoriasis patients
03-28, doi: 10.1111/bjd.17931
【主编评语】银屑病是一种慢性免疫疾病。 《British Journal of Dermatology》近期发表一项人群研究，发现银屑病患者的肠道菌群与健康人具有显著差异，可能存在菌群紊乱现象。该研究中银屑病患者的菌群结构变化有一定特殊性，对于研究银屑病中菌群-宿主互作具有一定参考价值。（@小肠君）
浙大医学院：解析肝衰竭患者的血液菌群
Liver International[IF:4.5]
① 对比50名乙肝相关慢加急性肝衰竭患者（HB-ACLF），23名健康人和25名代偿性肝硬化患者（C-LC）血浆中的细胞因子和菌群；② HB-ACLF患者血液中细菌DNA增加，菌群多样性降低；③ 莫拉菌科、硫菌属、丛毛菌属和伯克氏菌科富集，后者与趋化因子IP-10正相关；④ 普雷沃菌科的相对丰度独立预测了28天死亡率；⑤ 患者菌群中，有代谢甲烷、丙氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、嘧啶、嘌呤和能量相关基因有富集现象。
Characterization of the circulating microbiome in acute-on-chronic liver failure associated with hepatitis B
03-13, doi: 10.1111/liv.14097
【主编评语】乙肝相关慢加急性肝衰竭患者的血液中，细菌量可能会增加。浙大医学院团队近期在《Liver International》发表文章，发现患者体循环菌群多样性、结构和功能变化显著，而且与全身炎症及临床预后相关。该结果为解析慢加急性肝衰竭病理、预测预后具有参考机制。（@小肠君）
Nature子刊：Bcl9和Pygo或为结直肠癌早期治疗靶标
Nature Communications[IF:12.353]
① Apc功能完全丧失（ApcMin）或部分丧失（Apc1322T）的小鼠模型中，肠组织缺失Bcl9或Pygo均可延长小鼠的无病生存期，且基本治愈了Apc1322T小鼠的肠道瘤变；② Bcl9或Pygo缺失改变了腺瘤的基因表达情况，从干细胞样基因表达模式转变分化细胞的表达模式；③ 同时敲除Bcl9与Pygo时，对于瘤变的抑制作用强于单敲除；④ Bcl9缺失通过将β-连环蛋白重新定位到细胞表面来促进ApcMin小鼠中的肿瘤持留，在Apc1322T小鼠中未见这种作用。
Bcl9 and Pygo synergise downstream of Apc to effect intestinal neoplasia in FAP mouse models
02-13, doi: 10.1038/s41467-018-08164-z
【主编评语】Bcl9和Pygo是Wnt通路的增强体，影响β-连环蛋白依赖性转录。《Nature Communications》近期发表研究，发现Apc功能完全丧失（ApcMin）或部分丧失（Apc1322T）的结直肠癌小鼠模型中，敲除Bcl9和Pygo有助于避免瘤变，指出Bcl9和Pygo或为肿瘤早期的潜在治疗靶标。（@小肠君）
感谢本期日报的创作者：小肠君，女巫，李丹宜，段海蓉，张倩，祁玉丽，迟卉
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