生信宝典文章集锦
最近团队活动，去了趟草原，看看天，爬爬山，溜溜弯，放放马；没抽出时间继续更新，先整理下历史文章，不然慢慢都沉下去了，不方便看到。
这些文章当时设计的原则是：简单易懂，方便入门，快速提高。每篇文章都从最基础处落脚，整理出学习过程中遇到的坑、走过的弯路和提出的解决思路，分别列在不同的系列中（系列性文章最好从头看）。每部分都提供了测试数据、运行命令和示例结果，是学习使用必备宝典。
但根据大家在实际使用中的反馈来看，文章中确实还有不少介绍的不到位的地方。我们会根据反馈，逐渐完善之前漏掉的知识点，讲解不够细致的地方，还希望大家继续提出更多的意见和想要一起学习的部分。我们会根据安排逐步更新。
生物信息的学习不会是一蹴而就的，需要一定时间静下心来好好的练习、思考，理解手上正在做的东西。现在有些流程或软件，点一点就可以出结果，但如果对背后的原理、机制不了解，操作起来也会比较茫然。我们不提倡重复造轮子(开发新工具)，但鼓励知道轮子制造背后的原理。这样在正确使用工具、调整参数时更有底气，也对结果更有把握。
公众号现有内容都是生信分析的基础，再完善几个部分，就算告一段落了。后期将以实战分析、文章解读、文章还原、生信教程集锦为主要任务，提供更多干货。
程序学习心得
Linux 学习
R统计和作图
NGS基础
Python学习
NGS软件
Cytoscape网络图
分子对接
生信宝典之傻瓜式
生信人写程序
招聘
“宏基因组”文章目录
软件和数据库使用
SILVAngs: 扩增子16S/18S免费在线分析
antiSMASH: 微生物次生代谢物基因簇查询和预测
微生物网络构建：MENA, LSA, SparCC和CoNet
Genevestigator: 查找基因在发表研究中的表达
测序分析常用图表解读
1箱线图：Alpha多样性，老板再也不操心我的文献阅读
2散点图：Beta多样性，组间整体差异分析
3热图：差异菌、OTU及功能
4曼哈顿图：差异OTU或Taxonomy
5火山图：差异OTU数量及变化规律
6韦恩图：比较组间共有和特有OTU或分类单元
7三元图：美的不要不要的，再多用也不过分
8网络图：节点OTU或类Venn比较
科研经验
1云笔记积累个人知识体系
2云协作建立实验室工作总结和内部资料共享平台
3公众号建立实验室共享知识体系和宣传窗口
宏基因组14天原创-诚邀同行共享研究经验
如何注册一个名字好记的公众号
文献笔记
Nature Review：Microbiota, metagenome, microbiome傻傻分不清
Nature：功能微生物组—甘露糖苷选择性抑制致病性大肠杆菌
Nature: 植物微生物组开山—拟南芥根微生物组的结构和组成
Microbiome: 简单套路发高分文章—白杨内生和根际微生物组结构
QIIME2教程
1简介和安装
2人体微生物组分析实战Moving Pictures
3粪便菌群移植分析实战FMT
4沙漠土微生物组分析实战Atacama soil
5数据导入 6数据导出 7实验设计编写
8数据筛选 9训练物种分类器